盡管電子商務(wù)物流信息系統(tǒng)是企業(yè)經(jīng)營系統(tǒng)的一部分，與企業(yè)其他部門的管理系統(tǒng)在基本層面上沒有太大區(qū)別，但是，由于物流活動(dòng)本身具有的時(shí)空上的特點(diǎn)，使得電子商務(wù)物流信息系統(tǒng)具有如下特征。
(1)開放性
為實(shí)現(xiàn)物流企業(yè)管理或非物流企業(yè)物流管理的一體化和資源的共享，物流管理系統(tǒng)應(yīng)具備與公司內(nèi)部其他系統(tǒng)如財(cái)務(wù)、工資管理、人力資源管理等系統(tǒng)相連接的性能。且系統(tǒng)不僅要在企業(yè)內(nèi)部實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)的整合和順暢流通，還應(yīng)具備與企業(yè)外部的供應(yīng)鏈的各個(gè)環(huán)節(jié)進(jìn)行信息整合和數(shù)據(jù)交換的能力，達(dá)到各方面的無縫連接。物流信息系統(tǒng)應(yīng)用edi方式、門戶平臺(tái)方式和數(shù)據(jù)對(duì)接等多種接口方式來實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)整合和順暢流通。
(2)可擴(kuò)展性和靈活性
隨著社會(huì)經(jīng)濟(jì)的快速發(fā)展，企業(yè)的管理以及業(yè)務(wù)的變化也在加快，這就要求系統(tǒng)能夠隨著企業(yè)的變革而變革。如物流企業(yè)實(shí)施流程再造，采用了新的流程，原來的系統(tǒng)將可能無法適用新的流程。如果企業(yè)需要再進(jìn)行大規(guī)模投資，重新引進(jìn)新的管理系統(tǒng)就會(huì)造成資源的極大浪費(fèi)。所以物流信息系統(tǒng)要具備隨著企業(yè)發(fā)展而發(fā)展的能力，并考慮系統(tǒng)的靈活性。在建設(shè)物流信息系統(tǒng)時(shí)，應(yīng)充分考慮企業(yè)未來的管理及業(yè)務(wù)發(fā)展的需要，以便在原來系統(tǒng)的基礎(chǔ)上建立更高層次的管理模塊。
(3)安全性
局域網(wǎng)和互聯(lián)網(wǎng)是電子商務(wù)物流信息系統(tǒng)的一個(gè)基本運(yùn)行條件，它使物流企業(yè)觸角得以延伸更遠(yuǎn)、數(shù)據(jù)更集中，但安全性問題也隨之而來。在物流信息系統(tǒng)開發(fā)初期，其安全性往往被人們所忽略。但隨著系統(tǒng)開發(fā)的深入，特別是以網(wǎng)上銀行為主要支付手段的實(shí)現(xiàn)和電子單證的使用，安全性已成為電子商務(wù)物流信息系統(tǒng)的首要問題。它可分為內(nèi)部安全性問題和外部安全性問題。
(4)協(xié)同性
系統(tǒng)的協(xié)同性體現(xiàn)在其與客戶、企業(yè)各部門、供應(yīng)鏈各環(huán)節(jié)及社會(huì)各部門的協(xié)同等方面。
·與客戶的協(xié)調(diào)。系統(tǒng)應(yīng)具有和客戶的erp系統(tǒng)、庫存管理系統(tǒng)等實(shí)現(xiàn)連接的能力。系統(tǒng)可以定期給客戶發(fā)送各種物流信息，如庫存信息、車輛配送信息、催款提示等。
·與企業(yè)內(nèi)部備部門間的協(xié)同。如業(yè)務(wù)人員可將客戶、貨物的數(shù)據(jù)輸入系統(tǒng)，財(cái)務(wù)人員可根據(jù)業(yè)務(wù)人員輸入的數(shù)據(jù)進(jìn)行記賬、控制等處理。
·與供應(yīng)鏈上的其他環(huán)節(jié)的協(xié)同。如第三方物流公司應(yīng)與船公司、運(yùn)輸公司、拖車公司、倉儲(chǔ)公司、鐵路運(yùn)輸公司、公路運(yùn)輸公司等企業(yè)，通過網(wǎng)絡(luò)實(shí)現(xiàn)信息傳輸。
·與社會(huì)各部門的協(xié)同。即通過網(wǎng)絡(luò)與銀行、海關(guān)、稅務(wù)機(jī)關(guān)等部門實(shí)現(xiàn)信息即時(shí)傳輸。與銀行聯(lián)網(wǎng)，可以實(shí)現(xiàn)網(wǎng)上支付和網(wǎng)上結(jié)算，也可以查詢企業(yè)的資金信息；與海關(guān)聯(lián)網(wǎng)，可以實(shí)現(xiàn)網(wǎng)上報(bào)關(guān)等。
(5)動(dòng)態(tài)性
系統(tǒng)反映的數(shù)據(jù)應(yīng)該是動(dòng)態(tài)的，可隨著物流的變化而變化，能實(shí)時(shí)反映貨物流動(dòng)的各種狀況，支持客戶和公司員工的在線動(dòng)態(tài)查詢，這就需要公司內(nèi)部與外部數(shù)據(jù)通信應(yīng)及時(shí)、通暢。
(6)快速反應(yīng)
系統(tǒng)應(yīng)能對(duì)用戶、客戶的在線查詢、修改、輸入等操作作出快速和及時(shí)的反應(yīng)。在市場(chǎng)瞬息萬變的今天，企業(yè)需要跟上市場(chǎng)的變化才可在激烈的市場(chǎng)競(jìng)爭(zhēng)中生存。物流管理信息系統(tǒng)是物流企業(yè)的數(shù)字神經(jīng)系統(tǒng)，系統(tǒng)的每一神經(jīng)元滲入供應(yīng)鏈的每一末梢，而每一末梢的刺激都能引起系統(tǒng)的快速、適當(dāng)?shù)姆磻?yīng)。
(7)信息的集成性
物流過程中涉及的環(huán)節(jié)多、分布廣，信息隨著物流在供應(yīng)鏈上的流動(dòng)而流動(dòng)，信息在地理上往往具有分散、范圍廣、量大等特點(diǎn)，因此，信息的管理應(yīng)高度集成，同樣的信息只需要一次輸入，以實(shí)現(xiàn)資源共享，減少重復(fù)操作，減少信息的差錯(cuò)性。目前大型的關(guān)系型數(shù)據(jù)倉庫通過建立數(shù)據(jù)之間的關(guān)聯(lián)，基本可實(shí)現(xiàn)這一點(diǎn)。
(8)支持遠(yuǎn)程處理
物流過程往往涉及不同的部門并跨越不同的地區(qū)。在網(wǎng)絡(luò)時(shí)代，企業(yè)同客戶間的物理距離等都將變成鼠標(biāo)距離。物流管理信息系統(tǒng)應(yīng)支持遠(yuǎn)程的業(yè)務(wù)查詢、輸入和人機(jī)對(duì)話等事務(wù)處理功能。
(9)檢測(cè)、預(yù)警和糾錯(cuò)能力
為保證數(shù)據(jù)的準(zhǔn)確性和穩(wěn)定性，系統(tǒng)應(yīng)在各模塊中設(shè)置一些檢測(cè)小模塊，對(duì)輸入的數(shù)據(jù)進(jìn)行檢測(cè)，以把一些無效的數(shù)據(jù)排斥在外。例如，集裝箱箱號(hào)在編制時(shí)有一定的編碼規(guī)則，在輸入集裝箱箱號(hào)時(shí)，系統(tǒng)可以根據(jù)這些規(guī)則設(shè)置檢測(cè)模塊，提醒并避免操作人員輸入錯(cuò)誤信息。又如，許多公司的提單不能夠重復(fù)，系統(tǒng)在操作人員操作時(shí)都會(huì)自動(dòng)檢測(cè)校驗(yàn)。物流信息系統(tǒng)應(yīng)可以靈活設(shè)置預(yù)警機(jī)制、提示信息，如將緊急發(fā)貨的記錄設(shè)置為紅顏色顯示，在客戶欠款達(dá)到一定數(shù)量時(shí)自動(dòng)提示等。