(1)　中小規(guī)模企業(yè)沒有必要也無法整合物流
據(jù)行業(yè)統(tǒng)計，全國藥品批發(fā)企業(yè)1.65萬家，零售企業(yè)近14萬家，全國零售藥店總數(shù)12萬家、藥品生產(chǎn)企業(yè)6300多家。這些企業(yè)中95%以上都是中小型醫(yī)藥企業(yè)，雖然中小型醫(yī)藥企業(yè)在投入上無法與大型企業(yè)相比，無法成為供應鏈整合的領導者，但是作為現(xiàn)行醫(yī)藥供應體系中的一部分，任何一個供應鏈的優(yōu)化項目都離不開這一環(huán)節(jié)。在中國醫(yī)藥供應鏈整合逐步受到重視的將來，任何一個供應鏈中的成員也希望有這樣的戰(zhàn)略合作伙伴參與到項目中來，以共同探索成功之道。事實上，中小型醫(yī)藥企業(yè)可以在兩個層面上開展物流整合，以提高物流服務水平、降低物流成本。一是在作業(yè)層面上，積極優(yōu)化內部作業(yè)流程以提高效率和客戶服務水平，并探索與第三方醫(yī)藥物流企業(yè)的合作模式以取得成本降低;二是在戰(zhàn)略層面積極參與到大型企業(yè)領導的供應鏈整合中去，從上下游環(huán)節(jié)取得成本降低和服務提高。
(2)　設備和技術決定競爭能力
認為物流設備、技術越先進就越有利于強化企業(yè)競爭力，越能吸引客戶和戰(zhàn)略合作伙伴，在物流項目的建設上重技術先進性帶來的宣傳效應，而輕視了系統(tǒng)應用中的協(xié)調一致性，是當前國內醫(yī)藥物流投資的另一誤區(qū)。這一認識誤區(qū)的直接后果就是物流系統(tǒng)化、信息化、自動化不是為自己“量體裁衣”，與現(xiàn)有的業(yè)務規(guī)模和管理水平不匹配。事實上，作為一項系統(tǒng)工程，物流效率和服務水平的高低不是取決于整個系統(tǒng)最強的部分，而是取決于最薄弱的環(huán)節(jié)。單一技術環(huán)節(jié)的高要求、高投入并不能顯著改善整個物流系統(tǒng)的表現(xiàn)。從戰(zhàn)略投資者、商業(yè)合作伙伴或者是下游的客戶的角度來說，更注重的是整個物流系統(tǒng)的可靠性、完整性和物流整體服務水平的高低，而不是物流設備、技術的先進程度。中國的醫(yī)藥物流要由傳統(tǒng)的粗放型向現(xiàn)代化的信息型轉變，存在著政策法規(guī)、業(yè)態(tài)流程、經(jīng)營模式、觀念、軟件開發(fā)和人員這幾大障礙，這幾個主要的問題不解決，設備和技術再先進也無用武之地。
(3)　自動化帶來成本降低
自動化對降低物流成本的作用主要體現(xiàn)在兩個方面：一是工作效率提高后帶來的直接人工成本降低，二是差錯率降低后帶來的間接作業(yè)成本降低。各地企業(yè)投資自動化物流中心的熱情很高，申報的項目少則投資數(shù)千萬元，多則高達數(shù)億元。然而國內的現(xiàn)狀是：一方面企業(yè)在國營體制下很難裁減人員，進而降低人工成本，另一方面自動化設備上馬后每天要產(chǎn)生數(shù)萬元的能耗成本。更有甚者，由于國內電力供應緊張的關系，很多自動化設備只能處于半投產(chǎn)狀態(tài)，無法通過規(guī)?；?jīng)營來降低成本。因此，很多企業(yè)面臨的困境是：自動化物流中心上馬后，物流成本不降反升。
導致上述原因的就是我國醫(yī)藥企業(yè)對自動化的片面認識。一個先進的機械設備運行系統(tǒng)能否有效發(fā)揮作用，跟企業(yè)本身的信息化程度、信息化管理程度有很大的關聯(lián)，可是很多企業(yè)盲目的上信息化、物流機械化，沒有考慮是不是真正的適合自己企業(yè)的實際需求。事實上，我國的醫(yī)藥倉庫完全沒有必要上全自動的倉儲設備，國外之所以實現(xiàn)全自動化一是因為他們的人工成本高，二是因為他們的其它的配套環(huán)境：政策、人才、業(yè)務流程達到這樣的水平。而這兩大條件在我國尚不存在，所以這種物流設備的“全副武裝”應該是一個循序漸進的過程，當前只要針對自己的實際情況投入相應的設備就足夠了。