第一是信息技術、網(wǎng)絡技術的普及和發(fā)展，特別是互聯(lián)網(wǎng)技術解決了信息共享、信息傳輸?shù)臉藴蕟栴}和成本問題，使得信息更廣泛地成為控制、決策的依據(jù)和基礎。因此只要解決信息的采集、傳輸、加工、共享，就能提高決策水平，從而帶來效益。在這個層面上可以不涉及或少涉及流程改造和優(yōu)化的問題，信息系統(tǒng)的任務就是為決策提供及時、準確的信息。
第二是企業(yè)在利益機制的驅(qū)動下，不斷追求降低成本和加快資金周轉，將系統(tǒng)論和優(yōu)化技術用于物流的流程設計和改造，融入新的管理制度之中。此時的信息系統(tǒng)作用有二，其一是固化新的流程或新的管理制度，使其得以規(guī)范地貫徹執(zhí)行；其二是在規(guī)定的流程中提供優(yōu)化的操作方案，例如倉儲存取的優(yōu)化方案，運輸路徑的優(yōu)化方案等。此時信息系統(tǒng)作用主要在于固化管理和優(yōu)化操作。
第三個層面是供應鏈的形成和供應鏈管理的作用上升，其中物流管理是其主要組成部分。要解決的問題是提高整個供應鏈的效率和競爭力，主要是通過對上下游企業(yè)的信息反饋服務來提高供應鏈的協(xié)調(diào)性和整體效益，如生產(chǎn)企業(yè)與銷售企業(yè)的協(xié)同、供應商與采購商的協(xié)同等，物流信息系統(tǒng)不僅是供應鏈的血液循環(huán)系統(tǒng)，也是中樞神經(jīng)系統(tǒng)。供應鏈的基礎是建立利的利益機制，但是這種機制需要一定的技術方案來保證，信息系統(tǒng)在這里的主要作用是實現(xiàn)這種互利機制的手段。例如銷售商的庫存由供應商的自動補貨系統(tǒng)來管理，生產(chǎn)商的生產(chǎn)計劃根據(jù)銷售商的市場預測來安排等等。