一般情況下，跨境物流清關(guān)過程需要經(jīng)過兩個(gè)國(guó)家或地區(qū)海關(guān)部門的審核一一出口國(guó)海關(guān)與目的地國(guó)海關(guān)。而對(duì)于出口跨境電商而言，清關(guān)的難點(diǎn)主要集中在目的地國(guó)海關(guān)方面，海關(guān)部門對(duì)出現(xiàn)問題的包裹處理方式無外乎三種：提供相關(guān)文件后即可通行、貨物退還給發(fā)件單位、直接沒收。
對(duì)賣家來說，提供相關(guān)文件的后果無外乎延長(zhǎng)配送時(shí)間，稍微嚴(yán)重的可能會(huì)被賣家投訴，勉強(qiáng)還可接受。但退件及沒收，無疑會(huì)讓賣家蒙受目大損失。
造成跨境電商清關(guān)障礙的因素主要包括兩個(gè)方面：
其一，賣家對(duì)目的地國(guó)家的進(jìn)口政策不夠重視，比如，產(chǎn)品缺少國(guó)際認(rèn)證機(jī)構(gòu)提供的相關(guān)認(rèn)證、故意低報(bào)商品價(jià)值等;
其二，目的地國(guó)家的貿(mào)易壁壘高，以巴西為例，進(jìn)入巴西的國(guó)際包裹幾乎都要經(jīng)過海關(guān)部門的嚴(yán)格檢驗(yàn)，而且發(fā)貨方必須提供包括貨物價(jià)值聲明、收件人稅號(hào)、商業(yè)發(fā)票在內(nèi)的多種資料及文件，有時(shí)即便是資料齊全也會(huì)遭到巴西海關(guān)部門的各種刁難。
另外，在一些海關(guān)機(jī)構(gòu)信息化建設(shè)相對(duì)落后的國(guó)家，由于缺乏強(qiáng)大的智能處理系統(tǒng)提供支持，包裹通關(guān)主要流程需要用人力解決。這導(dǎo)致清關(guān)效率極其低下，對(duì)消費(fèi)者的購(gòu)物體驗(yàn)帶來了較為嚴(yán)重的負(fù)面影響。